As principais doenças que dizem respeito a função da glândula tireoide são o hipotireoidismo e o hipertireoidismo, sendo a Tireoidite de Hashimoto, que causa o hipotireoidismo de origem auto-imune, a mais frequente.
O hipotireoidismo pode levar a cansaço, sonolência, queda de cabelo, pele seca, dificuldade de perder peso, alteração do colesterol, alteração do fluxo menstrual e da função intestinal (podendo levar a constipação). Quando se inicia na fase infanto-juvenil, pode ainda levar a dificuldade de aprendizado e retardo do crescimento.
Já o hipertireoidismo leva a um estado de aceleração, com aumento da fome e perda de peso, sudorese excessiva e taquicardia.